Protein–RNA interactions for Protein: Q6P566

Lix1, Protein limb expression 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lix1Q6P566 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lix1Q6P566 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lix1Q6P566 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lix1Q6P566 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lix1Q6P566 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms