Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx19Q6P4T1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx19Q6P4T1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx19Q6P4T1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx19Q6P4T1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx19Q6P4T1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx19Q6P4T1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx19Q6P4T1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snx19Q6P4T1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx19Q6P4T1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx19Q6P4T1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms