Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep78Q6IRU7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep78Q6IRU7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep78Q6IRU7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep78Q6IRU7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep78Q6IRU7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep78Q6IRU7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep78Q6IRU7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep78Q6IRU7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms