Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud6aQ6IE21 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud6aQ6IE21 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Otud6aQ6IE21 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud6aQ6IE21 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms