Protein–RNA interactions for Protein: Q64345

Ifit3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3Q64345 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifit3Q64345 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifit3Q64345 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifit3Q64345 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifit3Q64345 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifit3Q64345 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifit3Q64345 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifit3Q64345 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifit3Q64345 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifit3Q64345 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifit3Q64345 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifit3Q64345 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit3Q64345 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifit3Q64345 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms