Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms