Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab34Q64008 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab34Q64008 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab34Q64008 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab34Q64008 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab34Q64008 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab34Q64008 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab34Q64008 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rab34Q64008 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab34Q64008 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab34Q64008 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms