Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan7Q62283 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan7Q62283 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan7Q62283 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan7Q62283 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan7Q62283 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan7Q62283 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan7Q62283 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan7Q62283 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan7Q62283 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan7Q62283 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan7Q62283 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan7Q62283 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms