Protein–RNA interactions for Protein: Q61656

Ddx5, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx5Q61656 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx5Q61656 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx5Q61656 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx5Q61656 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx5Q61656 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx5Q61656 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms