Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ift88Q61371 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ift88Q61371 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ift88Q61371 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ift88Q61371 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ift88Q61371 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ift88Q61371 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ift88Q61371 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ift88Q61371 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ift88Q61371 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ift88Q61371 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ift88Q61371 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift88Q61371 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ift88Q61371 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms