Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Igbp1Q61249 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Igbp1Q61249 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms