Protein–RNA interactions for Protein: Q61184

Mtnr1a, Melatonin receptor type 1A, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnr1aQ61184 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtnr1aQ61184 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtnr1aQ61184 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtnr1aQ61184 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtnr1aQ61184 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtnr1aQ61184 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mtnr1aQ61184 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtnr1aQ61184 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtnr1aQ61184 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtnr1aQ61184 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtnr1aQ61184 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtnr1aQ61184 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtnr1aQ61184 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtnr1aQ61184 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtnr1aQ61184 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtnr1aQ61184 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtnr1aQ61184 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtnr1aQ61184 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mtnr1aQ61184 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtnr1aQ61184 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms