Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HarsQ61035 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HarsQ61035 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HarsQ61035 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HarsQ61035 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HarsQ61035 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HarsQ61035 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HarsQ61035 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HarsQ61035 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HarsQ61035 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HarsQ61035 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HarsQ61035 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HarsQ61035 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HarsQ61035 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HarsQ61035 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HarsQ61035 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HarsQ61035 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HarsQ61035 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HarsQ61035 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HarsQ61035 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HarsQ61035 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HarsQ61035 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HarsQ61035 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HarsQ61035 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HarsQ61035 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HarsQ61035 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HarsQ61035 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms