Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ripk1Q60855 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk1Q60855 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk1Q60855 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk1Q60855 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk1Q60855 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk1Q60855 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk1Q60855 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk1Q60855 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk1Q60855 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk1Q60855 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk1Q60855 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk1Q60855 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk1Q60855 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms