Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyb561Q60720 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyb561Q60720 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyb561Q60720 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyb561Q60720 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyb561Q60720 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyb561Q60720 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyb561Q60720 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyb561Q60720 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyb561Q60720 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyb561Q60720 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyb561Q60720 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyb561Q60720 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyb561Q60720 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyb561Q60720 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyb561Q60720 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyb561Q60720 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyb561Q60720 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyb561Q60720 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyb561Q60720 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyb561Q60720 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyb561Q60720 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyb561Q60720 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyb561Q60720 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms