Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp13a3Q5XF89 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp13a3Q5XF89 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp13a3Q5XF89 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp13a3Q5XF89 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp13a3Q5XF89 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp13a3Q5XF89 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp13a3Q5XF89 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp13a3Q5XF89 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp13a3Q5XF89 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp13a3Q5XF89 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp13a3Q5XF89 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp13a3Q5XF89 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms