Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a6Q5U4D8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc5a6Q5U4D8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc5a6Q5U4D8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a6Q5U4D8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc5a6Q5U4D8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms