Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Scaf1Q5U4C3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Scaf1Q5U4C3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Scaf1Q5U4C3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Scaf1Q5U4C3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Scaf1Q5U4C3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Scaf1Q5U4C3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Scaf1Q5U4C3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Scaf1Q5U4C3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Scaf1Q5U4C3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Scaf1Q5U4C3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Scaf1Q5U4C3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Scaf1Q5U4C3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Scaf1Q5U4C3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Scaf1Q5U4C3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Scaf1Q5U4C3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Scaf1Q5U4C3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Scaf1Q5U4C3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Scaf1Q5U4C3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Scaf1Q5U4C3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Scaf1Q5U4C3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Scaf1Q5U4C3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Scaf1Q5U4C3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Scaf1Q5U4C3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Scaf1Q5U4C3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Scaf1Q5U4C3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Scaf1Q5U4C3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Scaf1Q5U4C3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Scaf1Q5U4C3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Scaf1Q5U4C3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Scaf1Q5U4C3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Scaf1Q5U4C3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Scaf1Q5U4C3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Scaf1Q5U4C3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Scaf1Q5U4C3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Scaf1Q5U4C3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Scaf1Q5U4C3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Scaf1Q5U4C3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Scaf1Q5U4C3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms