Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms