Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf145Q5SWK7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf145Q5SWK7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf145Q5SWK7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf145Q5SWK7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf145Q5SWK7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf145Q5SWK7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms