Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms