Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rnf215Q5SPX3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf215Q5SPX3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf215Q5SPX3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf215Q5SPX3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf215Q5SPX3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf215Q5SPX3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf215Q5SPX3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf215Q5SPX3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf215Q5SPX3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf215Q5SPX3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf215Q5SPX3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf215Q5SPX3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf215Q5SPX3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms