Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc44a5Q5RJI2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc44a5Q5RJI2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a5Q5RJI2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a5Q5RJI2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a5Q5RJI2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a5Q5RJI2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a5Q5RJI2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a5Q5RJI2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a5Q5RJI2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a5Q5RJI2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc44a5Q5RJI2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc44a5Q5RJI2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms