Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps41Q5KU39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps41Q5KU39 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps41Q5KU39 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps41Q5KU39 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps41Q5KU39 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps41Q5KU39 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps41Q5KU39 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms