Protein–RNA interactions for Protein: Q5I1X5

Ppp1r13l, RelA-associated inhibitor, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r13lQ5I1X5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp1r13lQ5I1X5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp1r13lQ5I1X5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp1r13lQ5I1X5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp1r13lQ5I1X5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp1r13lQ5I1X5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp1r13lQ5I1X5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp1r13lQ5I1X5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp1r13lQ5I1X5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp1r13lQ5I1X5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp1r13lQ5I1X5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp1r13lQ5I1X5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppp1r13lQ5I1X5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp1r13lQ5I1X5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r13lQ5I1X5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r13lQ5I1X5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r13lQ5I1X5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r13lQ5I1X5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r13lQ5I1X5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r13lQ5I1X5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r13lQ5I1X5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r13lQ5I1X5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r13lQ5I1X5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r13lQ5I1X5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r13lQ5I1X5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r13lQ5I1X5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms