Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc84Q4VA36 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc84Q4VA36 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc84Q4VA36 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc84Q4VA36 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc84Q4VA36 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc84Q4VA36 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc84Q4VA36 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc84Q4VA36 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc84Q4VA36 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc84Q4VA36 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc84Q4VA36 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc84Q4VA36 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms