Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil2Q3V3V9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil2Q3V3V9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil2Q3V3V9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil2Q3V3V9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil2Q3V3V9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil2Q3V3V9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil2Q3V3V9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil2Q3V3V9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil2Q3V3V9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Carmil2Q3V3V9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Carmil2Q3V3V9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Carmil2Q3V3V9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Carmil2Q3V3V9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Carmil2Q3V3V9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Carmil2Q3V3V9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Carmil2Q3V3V9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Carmil2Q3V3V9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil2Q3V3V9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carmil2Q3V3V9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil2Q3V3V9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carmil2Q3V3V9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carmil2Q3V3V9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil2Q3V3V9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil2Q3V3V9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms