Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC051142Q3V0M8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC051142Q3V0M8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BC051142Q3V0M8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BC051142Q3V0M8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BC051142Q3V0M8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC051142Q3V0M8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms