Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfn4Q3UV66 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn4Q3UV66 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn4Q3UV66 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn4Q3UV66 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn4Q3UV66 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn4Q3UV66 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn4Q3UV66 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slfn4Q3UV66 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn4Q3UV66 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn4Q3UV66 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn4Q3UV66 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slfn4Q3UV66 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.1 ms