Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arhgef9Q3UTH8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef9Q3UTH8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arhgef9Q3UTH8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arhgef9Q3UTH8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgef9Q3UTH8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms