Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxred2Q3USW5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxred2Q3USW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxred2Q3USW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxred2Q3USW5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxred2Q3USW5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxred2Q3USW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxred2Q3USW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxred2Q3USW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Foxred2Q3USW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms