Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp36Q3UFY0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp36Q3UFY0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp36Q3UFY0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp36Q3UFY0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp36Q3UFY0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms