Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atxn7l3bQ3UD01 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atxn7l3bQ3UD01 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn7l3bQ3UD01 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn7l3bQ3UD01 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms