Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip13Q3UA06 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip13Q3UA06 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip13Q3UA06 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip13Q3UA06 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip13Q3UA06 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip13Q3UA06 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip13Q3UA06 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip13Q3UA06 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip13Q3UA06 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip13Q3UA06 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip13Q3UA06 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trip13Q3UA06 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip13Q3UA06 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trip13Q3UA06 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip13Q3UA06 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip13Q3UA06 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms