Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LcorlQ3U285 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LcorlQ3U285 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LcorlQ3U285 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LcorlQ3U285 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LcorlQ3U285 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LcorlQ3U285 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms