Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pag1Q3U1F9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pag1Q3U1F9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pag1Q3U1F9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pag1Q3U1F9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pag1Q3U1F9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.6 ms