Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C4

Secisbp2, MCG1271, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2Q3U1C4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Secisbp2Q3U1C4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Secisbp2Q3U1C4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Secisbp2Q3U1C4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Secisbp2Q3U1C4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Secisbp2Q3U1C4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms