Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc9Q3U0M1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc9Q3U0M1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc9Q3U0M1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc9Q3U0M1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trappc9Q3U0M1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc9Q3U0M1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc9Q3U0M1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc9Q3U0M1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc9Q3U0M1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc9Q3U0M1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc9Q3U0M1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc9Q3U0M1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc9Q3U0M1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc9Q3U0M1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms