Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ogfod1Q3U0K8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ogfod1Q3U0K8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ogfod1Q3U0K8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ogfod1Q3U0K8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ogfod1Q3U0K8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ogfod1Q3U0K8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ogfod1Q3U0K8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ogfod1Q3U0K8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ogfod1Q3U0K8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ogfod1Q3U0K8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ogfod1Q3U0K8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ogfod1Q3U0K8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ogfod1Q3U0K8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ogfod1Q3U0K8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ogfod1Q3U0K8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ogfod1Q3U0K8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ogfod1Q3U0K8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ogfod1Q3U0K8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ogfod1Q3U0K8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ogfod1Q3U0K8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ogfod1Q3U0K8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ogfod1Q3U0K8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ogfod1Q3U0K8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ogfod1Q3U0K8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ogfod1Q3U0K8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ogfod1Q3U0K8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ogfod1Q3U0K8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ogfod1Q3U0K8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ogfod1Q3U0K8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ogfod1Q3U0K8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ogfod1Q3U0K8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ogfod1Q3U0K8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ogfod1Q3U0K8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ogfod1Q3U0K8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ogfod1Q3U0K8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ogfod1Q3U0K8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ogfod1Q3U0K8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ogfod1Q3U0K8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ogfod1Q3U0K8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ogfod1Q3U0K8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ogfod1Q3U0K8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ogfod1Q3U0K8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms