Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccndbp1Q3TVC7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccndbp1Q3TVC7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccndbp1Q3TVC7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccndbp1Q3TVC7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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