Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ctdnep1Q3TP92 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ctdnep1Q3TP92 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ctdnep1Q3TP92 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1Q3TP92 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ctdnep1Q3TP92 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctdnep1Q3TP92 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ctdnep1Q3TP92 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms