Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf3c3Q3TMP1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf3c3Q3TMP1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf3c3Q3TMP1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf3c3Q3TMP1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf3c3Q3TMP1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf3c3Q3TMP1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gtf3c3Q3TMP1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf3c3Q3TMP1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms