Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Specc1lQ2KN98 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Specc1lQ2KN98 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Specc1lQ2KN98 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Specc1lQ2KN98 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Specc1lQ2KN98 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Specc1lQ2KN98 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms