Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLK6

B3gnt4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt4Q1RLK6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B3gnt4Q1RLK6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3gnt4Q1RLK6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3gnt4Q1RLK6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3gnt4Q1RLK6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3gnt4Q1RLK6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3gnt4Q1RLK6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
B3gnt4Q1RLK6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3gnt4Q1RLK6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B3gnt4Q1RLK6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3gnt4Q1RLK6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B3gnt4Q1RLK6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms