Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms