Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem52bQ0VBF2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmem52bQ0VBF2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem52bQ0VBF2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem52bQ0VBF2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms