Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pate4Q09098 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pate4Q09098 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pate4Q09098 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pate4Q09098 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms