Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnn2Q08093 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnn2Q08093 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnn2Q08093 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnn2Q08093 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnn2Q08093 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnn2Q08093 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnn2Q08093 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms