Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrstQ06666 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrstQ06666 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrstQ06666 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrstQ06666 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrstQ06666 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrstQ06666 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrstQ06666 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrstQ06666 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrstQ06666 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrstQ06666 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrstQ06666 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms