Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r236Q05A06 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r236Q05A06 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r236Q05A06 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r236Q05A06 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r236Q05A06 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms